Научные проекты и соглашения РГП «НРЦВ»
РГП «НРЦВ» принимал непосредственное активное участие в различных научно-исследовательских проектах, а также в сотрудничестве с научными институтами Казахстана и других Государств.
- Проект «Twinninglab» Один из международных проектов, в период 2013-2015гг., в котором непосредственно участвовал РГП «НРЦВ» как кандидат на получение статуса международной референтной лаборатории МЭБ по бруцеллезу в Средне-Азиатском регионе, на основании соглашения о программе сотрудничества в области ветеринарии между Правительством Республики Казахстана и МЭБ. Данное соглашение было подписано в период с 9 по 13 июля 2012 года на официальном визите генерального директора МЭБ доктора Бернард Валла в Республику Казахстан.
Сам проект активно начал функционировать с декабря 2013 года как сотрудничество между лабораторией колаборатором, являющимся действующей международной референтной лаборатории МЭБ по бруцеллезу и лабораторией претендентом на приобретение данного статуса и действует под названием «Twinning lab».
Финансирование проекта осуществлялось Международным Эпизоотическим Бюро (МЭБ), г. Париж, Франция, которое включает в себя поставку реагентов и материалов для выполнения целей проекта и поездки специалистов на обучение в Институт Зоопрофилактики, г. Терамо, Италия.
1.1 Цель проекта – получение РГП «НРЦВ» статуса международной референтной лаборатории МЭБ по бруцеллезу в Средне-Азиатском регионе.
Колаборатором в данной программе выступал Институт Зоопрофилактики (IZSAM) г. Терамо при Министерстве здравоохранения Италии который в целом составляет команда ученных с большим международным опытом. Институт (IZSAM) сотрудничает со многими международными институтами зарубежных стран (более 90 стран) и международными организациями, такими как ВОЗ, ФАО и МЭБ. Основные проектные территории — это Западная Европа, Латинская Америка, Африка и Азия. Основная цель Института IZSAM – это профилактика заболеваний животных, для предупреждения заражения человека.
1.2 Задачи проекта – повышение уровня технических знаний персонала РГП «НРЦВ», внедрение методик, стандартов, рекомендованных МЭБ как в РГП «НРЦВ», так и на всей территории РК; внедрение методов для создания коллекции Национальных стандартных образцов (эталонов) с применением общепринятых международных валидационных процедур; проведение семинаров для всех ветеринарных лабораторий РК, а также соседних стран.
Задачи по повышению уровня технических знаний персонала РГП «НРЦВ» включают обучение персонала лаборатории следующей деятельности:
— серологическая диагностика бруцеллеза;
— бактериологические процедуры по изоляции и характеристике бруцелл;
— молекулярные инструменты идентификации бруцелл;
— эпидемиологическое состояние бруцеллеза животных;
— контроль качества результатов;
— валидация методов испытаний и проверка результатов испытаний;
— процедуры по биобезопасности;
— обучающие тренинги и публикации.
|
№ п/п |
Наименование мероприятий |
Сроки реализации |
Участники |
|
1. |
Получение результатов от проведенных в декабре 2014 года сличительных испытаний по серологическим исследованиям, организованные IZSAM. Анализ результатов. |
Январь 2015 г. |
Специалисты отдела серологии лаборатории ДИЗ |
|
2. |
Отправка выделенных образцов ДНК бруцелл в IZSAM для сличения результатов, полученных в НРЦВ с целью дальнейшего проведения MLVA анализа. |
Февраль 2015 г. |
Специалисты отдела молекулярной биологии |
|
3. |
Проведение семинара по лабораторным исследованиям бруцеллеза на основе полученных знаний в |
24-26.02.2015 г. |
Специалисты 7 филиалов РГП «РВЛ» областей: ВКО, ЮКО, Алматинской, Кызыл-Ординской, Карагандинской, Жамбылской, Акмолинской. Специалисты отдела по бруцеллезу РГП «КазНИВИ» |
|
3.1 |
Проведение семинара серологии на тему “Серологические методы диагностики бруцеллеза по международным стандартам” |
||
|
3.2 |
Тренинг по бактериологии на тему «Внедрение бактериологического метода исследования бруцеллеза рекомендованные МЭБ» |
||
|
3.3 |
Тренинг по молекулярной генетике на тему «Внедрение молекулярно-биологических методов исследований по диагностике бруцеллеза, типизации бруцелл и биотипирование» |
||
|
4. |
Диагностическая работа по бруцеллезу – сбор сыворотки крови, патологического материала на территории РК, выделение чистой культуры, генотипирование, сличительные испытания. |
февраль-сентябрь 2015 г. |
Лаборатория ДИЗ РГП «НРЦВ» |
|
5. |
Проведение семинара по лабораторным исследованиям бруцеллеза на основе полученных знаний в IZSAM для специалистов ветеринарных лабораторий РК и соседних Государств – Кыргыстан, Узбекистан, Туркмения, Таджикистан |
10-12.06.2015 г. |
Специалисты 7 филиалов РГП «РВЛ» областей: Павлодарская, СКО, Атырауская, Мангистауская, Актюбинская, Костанайская, ЗКО. Специалисты отдела по бруцеллезу РГП «КазНИВИ» |
|
5.1 |
Проведение семинара серологии на тему “Серологические методы диагностики бруцеллеза по международным стандартам” |
||
|
5.2 |
Тренинг по бактериологии на тему «Внедрение бактериологического метода исследования бруцеллеза рекомендованные МЭБ» |
||
|
5.3 |
Тренинг по молекулярной генетике на тему «Внедрение молекулярно-биологических методов исследований по диагностике бруцеллеза, типизации бруцелл и биотипирование» |
||
|
5.4 |
Тренинг по эпидемиологии на тему «Анализ эпизоотического состояния по бруцеллезу в РК за 2014 г.» |
||
|
6. |
Проведение промежуточного рабочего аудита с демонстрацией полученных знаний, навыков, результатов в проекте «Твининг лаб» в ходе приезда в НРЦВ экспертов IZSAM |
28 июля -2 августа 2015 г. |
Приезд аудиторов с IZSAM: |
|
7. |
Проведение финального аудита с демонстрацией полученных знаний, навыков, результатов в проекте «Твининг лаб» в ходе приезда в НРЦВ экспертов IZSAM, отче по корректированным действиям |
1-2 декабря 2015 г. |
Приезд аудиторов с IZSAM и эксперта аудитора с МСХ США |
|
8. |
Проведение финального международного семинара по бруцеллезу. Доклады по результатам работы в проекте «Твининг лаб». |
3-4 декабря 2015г. |
Приглашенные специалисты ветеринарных организаций Казахстана, Кыргызстана, Таджикистана, Узбекистана, Экперты аудиторы с института IZSAM, Италия, эксперт аудитор с МСХ США. |
|
9. |
Предоставление отчета в МЭБ о проведенных работах в рамках проекта |
декабрь 2015 г. |
Экперты аудиторы с института IZSAM, Италия, эксперт аудитор с МСХ США, руководство РГП «НРЦВ» |
- Проект CAP-3.
В 2014-2015 в РГП НРЦВ проводился международный проект Проекта CAP-3 на тему “Целостность заархивированных образцов для использования в целях надзора над катаральной лихорадкой овец, болезнями Акабане и Шмалленберга”
Настоящее Соглашение было заключено между Представительством «Технолоджи Менеджмент Кoмпани Инк.» (Technology Management Company Inc.) (далее — «TMC») и РГП «Национальный референтный центр по ветеринарии».
2.1. Краткий обзор Проекта
В рамках Программы по уменьшению биологической угрозы (ПУБУ) Агентства по уменьшению угрозы Министерства Обороны США (АУУ МО США) в Казахстане, были внедрены молекулярные методы для выявления сопуствующих болезней переносчиков в проектах Совместных Биологических Исследований (СБИ), включая KZ-4, KZ-29, TAP-2, TAP-4, и наблюдения в рамках программы обнаружения и реагирования опасных биоагентов (ООБР). АУУ МО США также финансирует строительство Центральной референтной лаборатории (ЦРЛ) при Казахском научном центре карантинных и зоонозных заболеваний (КНЦКЗИ) в Алматы, Казахстан, в котором будут сертифицированные лаборатории 3-го уровня биобезопасности (BSL-3) и депозитарии для защиты коллекций особо опасных патогенов (ООП). ЦРЛ будет главным национальным диагностическим и референтным учреждением, где будут сочетаться и современные (иммуноанализ и генетика) диагностика, секвенирование, и традиционные микробиологические методы. Поскольку Проекты по деятельности ЦРЛ (CAP) по графику должны быть закончены до пуска ЦРЛ в эксплуатацию, исследования CAP позволяют получить опыт для дальнейшего выявления и проработки пробелов для более гладкого перевода ЦРЛ в рабочее состояние. Данное исследование CAP-3 включало в себя оценку заархивированных образцов сыворотки для скрининга с использованием недавно разработанных диагностических анализов для наблюдения соответствующих вновь возникающих инфекций, которые могут повлиять на Казахстан. Результаты данного исследования в будущем помогут разработать и укрепить процедуры института для надзора за болезнями, хранения образца, и биобезопасность.
CAP-3 – это одногодичное исследование, которое включало в себя бюджет на материалы и реагенты. Исследования проводили сотрудники РГП «НРЦВ» одного казахстанского института и коллабораторов из США; при поддержке AECOM. Коллабораторы по проекту из США, которые уже заняты в проектах СБИ, подключат участников из института для внедрения требуемых анализов и укрепления системы надзора с целью идентификации возбудителей этих заболеваний на более ранних этапах и с большей точностью. Кроме того, требуемые исходные данные помогут нам сравнить имеющиеся исторические данные, имеющиеся в разных институтах и будущие данные для определения истинного масштаба проблем, вызванных данными возбудителями. Особое внимание будет сделано на укрепление системы надзора, требуемой для быстрой идентификации любой вспышки из архивированных образцов.
2.2. Текущий прогресс
Все лабораторные исследования были завершены в конце мая 2015 года. Кроме того, в июле был разработан тезисный доклад для совещания CRWAD и направлен на рассмотрение АУУ МО США; комментарии АУУ МО США были включены в отредактированный доклад. Сам проект, в соответствии с графиком, был завершен 2 октября 2015 года.По данному докладу и отчету о результатах исследований был составлен постер, который был презентован на международной конференции CRWAD (Чикаго, 6-8 декабря).
- Проект ТАР-7.
В 2015 году в РГП НРЦВ проводился международный проект Проекта ТАР-7 на тему “Информационно-разъяснительная работа с населением для углубления понимания экологии и эпидемиологии африканской чумы свиней (АЧС) в Казахстане, Грузии, Армении и Украине: обучение и осуществление методов по контролю и профилактике” Настоящее Соглашение было заключено между Представительством «Технолоджи Менеджмент Кoмпани Инк.» (Technology Management Company Inc.) (далее — «TMC») и РГП «Национальный референтный центр по ветеринарии».
3.1. Краткий обзор Проекта
Развитие комплексной и устойчиво работающей сети знаний, экспертов и «ноу-хау» в области контроля и профилактики случаев заражения африканской чумы свиней (АЧС) при помощи проекта в рамках работы ООБР на основе совместных усилий, который включает в себя четыре страны (Армения, Грузия, Казахстан, и Украина) в общем Плане научной работы (Форма A) на основании осуществляемой совместной деятельности.
Необходимость определения: пробелы в знаниях, законодательной базе и готовности к вспышкам. Поскольку данный патоген имеет большой потенциал для биотерроризма, и обладает большой значимостью для здравоохранения и ветеринарии, и/или считается причиной значительной нестабильности в экономике, критически важным для стран, подвергающихся угрозе АЧС, является наличие инфраструктуры для точного и быстрого выявления и информирования международных организаций в области здравоохранения о работе по АЧС, а также обеспечение ответных мер в отношении распространения вируса. Данный проект попытается определить ключевые человеческие ресурсы и ветеринарные системы для того, чтобы приступить к осуществлению решений для устранения выявленных пробелов, тем самым увеличивая возможности по смягчению риска АЧС.
3.2. Цель: Обучение и осуществление устойчиво функционирующей кампании по образованию для повышения информированности общественности об АЧС, целью которой является:
3.3. Выполнение проекта:
— Были созданы региональные совместные рабочие группы по АЧС, включая представителей из Армении, Грузии, Казахстана, и Украины и других должностных лиц из международных бюро по ветеринарии и продовольствию.
— Были определены ключевые группы, которые должны эффективно осуществлять необходимые методы по снижению и распространению АЧС (ветеринары МИО, работники свиноферм, руководители служб по регулированию ресурсов живой природы и егери).
— Путём сотрудничества с FАО и экспертами были созданы и распространены учебные материалы для ключевого персонала в областях и районах, подверженные риску заражения АЧС, а также проведены семинары с ветеринарными службами МИО, работниками свиноферм, руководителями служб по регулированию ресурсов живой природы и егерями, а также подворный обход (рис 1).
Рис. 1 — Районы подверженные риску заноса АЧС по Казахстану с Российской федерации
3.3.1. Проведение семинаров и распространение раздаточного материала по Республике Казахстан:
— в Западно-Казахстанской области в период сентября месеяца 2015 года в 7 районах, граничащих с Российской Федерацией или имеющие большое свинопоголовье.
Всего предоставлено 2800 листовок и 51 плакат
— в Актюбинской области в период август месяца 2015 года в 5 районах граничащих с Российской Федерацией или имеющие большое свинопоголовье.
Предоставлено 320 листовок и 25 плакатов
— в Костанайской области в 5 районах граничащих с Российской Федерацией или имеющие большое свинопоголовье
Предоставлено 1170 листовок и 25 плакатов
— в Северо-Казахстанской области в период сентября месеяца 2015 года в 8 районах, граничащих с Российской Федерацией или имеющие большое свинопоголовье.
Роздано 3000 листовок и 75 плакатов
- KZ-2 — «Экология и эпидемиология бруцеллеза в Юго-восточном Казахстане».
В данный совместный проект были включены следующие институты, от Американской стороны «Технолоджи Менеджмент Кoмпани Инк.» (Technology Management Company Inc.) (далее — «TMC»), от Казахстанской стороны ГУ «Национальный референтный центр по ветеринарии» КВКиН МСХ РК, РГКП «Научно-практический центр санитарно-эпидемиологической экспертизы и мониторинга» МЗ РК, РГКП «Казахский научный центр карантинных и зоонозных инфекций им. М. Айкимбаева» МЗ РК.
Проект долгосрочный, был разделен на 2 фазы, I фаза проекта осуществлялась в период с 2005 по 2009 годы, II фаза началась в 2012 году и окончена в апреле 2014 года.
Финансирование проекта осуществляла Американская сторона, которое включала в себя зарплату специалистам, выполняющие непосредственную работу, поставку реагентов и материалов для выполнения проекта, поездки на международные научные конференции, семинары и тренинги.
От РГП «НРЦВ» в II фазе проекта участвовало 21 специалист.
Колобораторами проекта были — специалисты Научно-исследовательского института им. Уолтера Рида Сухопутных войск США; Техасского сельскохозяйственно-механического университета (TAMU), США; Университета штата Луизиана, кафедры ветеринарных наук, Центра сотрудничества по использованию дистанционной радиолокации и Глобальной информационной системы в здравоохранении Всемирной организации здравоохранения, США; Кафедры географии и антропологии Университета штата Луизиана, США.
4.1. Основными целями Проекта было: эффективное обучение и внедрение стандартных методов эпидемиологии, включая систему отчетности посредством ЭИСНЗ, которая послужит дальнейшей интеграции мероприятий в рамках СБИ и TADR; внедрение дополнительных научных методов, таких как оптимизация анализов qPCRи фаготипирование, что обеспечит последовательность предыдущих мероприятий (например, MLVA-8); содействие институтам в разработке процедур по улучшению системы реагирования на вспышки заболеваний людей и животных и усилению взаимодействия при реагировании на такие вспышки; ускорение консолидации штаммов ООИ и подготовка мероприятий в рамках ЦРЛ на базе РГКП «КНЦКЗИ»; совершенствование навыков и ключевых научных возможностей в соответствующих институтах для проведения текущих и будущих проектов СБИ в целях обеспечения долгосрочного устойчивого развития; разработка и внедрение единой системы надзора за заболеваниями, которая может быть полностью использована институтами для собственных целей при условии, что результаты такого использования будут отвечать вышеназванным целям и включать публикации статей, прошедших экспертную оценку, сотрудничество с международным научным сообществом и иную работу, направленную на получение дополнительного финансирования извне.
В 2014 году с 15 по 26 апреля была продолжена научная работа по проведению Анализа VNTR/MLVA видов Brucella при помощи системы генетического анализа Beckman CEQ. На базе НПЦСЭЭМ совместно с коллабораторами, докторами Николичем и Хуанг были проведены и закончены основные исследования по секвенированию штаммов с 1-й фазы и со 2-й фазы проекта.
В проведении работы по внедрению MLVA 15 фазы 2, участвовали специалисты НПЦСЭЭМ совместно с НРЦВ. Мультиплексная реакция проводилась на 5 пар праймеров, на 3-пары и на 7-пар праймеров. Совместно с коллабораторами США изучались и анализировались медицинские и ветеринарные изоляты бруцелл. Итого провели мультиплексную реакцию на 15 пар праймеров, изучили 67 медицинских изолятов со 2-й фазы, 19 штаммов оставшиеся с 1-й фазы, а также ветеринарные изоляты.
Специалисты НПЦСЭЭМ с коллаборатором доктором Джейсоном Блэкбурном продолжили работу по ГИС с 17 по 20 марта 2014г., внедрение географических данных в карту.
Параллельно на базе НРЦВ в г. Астана был проведен тренинг по фаготипированию.
- ТАР-4 – «Применение подхода дифференциации инфицированных и вакцинированных животных (DIVA) в целях надзора за заболеванием ящура в Казахстане».
В данный совместный проект были включены следующие институты, от Американской стороны «Технолоджи Менеджмент Кoмпани Инк.» (Technology Management Company Inc.), от Казахстанской стороны РГП «Национальный референтный центр по ветеринарии» КВКиН МСХ РК.
В рамках Программы уменьшения биологической угрозы АУУ МО США (ПУБУ), Система обнаружения опасных биореагентов и реагирования (ООБР) также поддерживает диагностические протоколы, которые включают в себя выявление ящура методом qПЦР и надзор за использованием сыворотки методом ИФА.
В данном проекте, для рассмотрения важных аспектов надзора за случаями заболевания ящуром, включая выявление неструктурных белков (NSP) в сыворотке животных, как показателя инфекции и сравнение геномных последовательностей во время вспышек в Казахстане, предлагается применение подхода DIVA (дифференциация инфицированных и вакцинированных животных).
Были использованы данные и образцы, полученные из мест недавних вспышек ящура, в том числе образцы сыворотки полученные из известных зон свободных от ящура, эндемичных зон и зон эпидемии в Республике Казахстан.
Период реализации проекта пришелся на 1 января 2011 по июнь 2013 годов.
Данные исследования очень важны для обнаружения и анализа эпизоотической ситуации в стране в целом, поскольку для дальнейшего осуществления профилактических мер против ящура требуется осуществлять мониторинг новых вспышек. Проводить сравнительный анализ вероятности выявления антигенов у вакцинированных и не вакцинированных животных в рамках проекта TAP -4.